子科生物報道:快速抗原檢測的可用性極大地推動了遏制COVID-19傳播的努力，但每一種新的擔(dān)憂都引發(fā)了診斷檢測是否仍然有效的問題。發(fā)表在《細胞》雜志上的一項新研究試圖解決這些問題，方法是評估在未來的SARS-CoV-2變種挑戰(zhàn)下，檢測的速度如何。

該研究團隊由埃默里大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)，由美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)快速加速診斷(RADx)技術(shù)項目資助，開發(fā)了一種新的方法，用于評估新冠病毒的突變?nèi)绾斡绊懣焖倏乖瓩z測中使用的抗體的識別。因為大多數(shù)快速抗原檢測都是檢測SARS-CoV-2核衣殼蛋白(N蛋白)，該團隊直接測量了N蛋白的突變?nèi)绾斡绊懺\斷抗體識別目標的能力。

埃默里大學(xué)生物化學(xué)系助理教授、第一篇研究報告的作者Filipp Frank博士說:“根據(jù)我們的發(fā)現(xiàn)，令人擔(dān)憂的SARS-CoV-2的主要變體都不包含會影響當(dāng)前快速抗原檢測抗體能力的突變。此外，這些數(shù)據(jù)使我們能夠提前一步，針對可能出現(xiàn)的幾乎任何變體預(yù)測測試性能?！?/p>

該研究使用了一種稱為深度突變掃描（Deep mutational scanning）的方法，在一個單一的高通量實驗中評估N蛋白中所有可能的突變。然后，研究人員測量了突變對它們與11種商用快速抗原檢測中使用的抗體相互作用的影響，并確定了可能導(dǎo)致抗體逃逸的突變。

埃默里大學(xué)生物化學(xué)系教授、資深研究作者Eric Ortlund博士說:“準確和有效地識別受感染者仍然是減緩COVID-19的一項至關(guān)重要的策略，我們的研究提供了關(guān)于未來可能干擾檢測的SARS-CoV-2突變的信息。這里概述的結(jié)果可以讓我們快速適應(yīng)病毒的新變種繼續(xù)出現(xiàn)，代表著立即的臨床和公共衛(wèi)生影響?！?/p>

研究結(jié)果表明，變異中N蛋白發(fā)生突變從而躲過診斷測試的情況相對罕見，但有一小部分序列可能會影響檢測。研究人員、公共衛(wèi)生官員和測試制造商可以使用這些數(shù)據(jù)來確定診斷測試是否需要評估其檢測這些突變的能力，或為未來的測試設(shè)計提供信息。

國家生物醫(yī)學(xué)成像和生物工程研究所(NIBIB)主任、NIH RADx?技術(shù)項目負責(zé)人Bruce J. Tromberg博士說:“考慮到新變體的無盡循環(huán)，這項研究的數(shù)據(jù)在未來幾年將是有用的?！?br>

雖然許多擔(dān)憂的變體包含N蛋白的多重突變，但研究作者指出，他們的方法沒有評估多重突變?nèi)绾斡绊懺\斷抗體識別，這代表了該研究的局限性。

文章標題

Deep mutational scanning identifies SARS-CoV-2 Nucleocapsid escape mutations of currently available rapid antigen tests