深圳子科生物報道：中山大學李陳龍教授課題組正式發(fā)表了題為“Verification of DNA Motifs in Arabidopsis using CRISPR/Cas9 Mediated Mutagenesis”的研究論文，報道了采用CRISPR/Cas9技術在植物體內驗證由染色體免疫沉淀結合下一代測序獲得的DNA基序。

這一研究成果公布在植物學一區(qū)雜志Plant Biotechnology Journal（IF=6.25）上，中山大學李陳龍教授為論文第一作者和通訊作者，中山大學是第一完成單位，來自加拿大農業(yè)部的陳琛博士為論文共同第一作者。研究受到青年千人計劃項目的支持。

轉錄因子和染色體修飾蛋白通過識別特異的DNA基序來實現它們對靶標染色體的結合。染色體免疫沉淀結合下一代測序（ChIP-seq）已經被廣泛用于發(fā)掘潛在的被轉錄因子和染色體修飾蛋白識別的DNA基序。然而，在植物體內驗證這些DNA基序的方法一直缺乏。

在這項研究中，研究人員采用CRISPR/Cas9技術特異的刪除或修改前期發(fā)現的組蛋白H3K27去甲基化酶REF6的識別基序CTCTGYTY。研究人員發(fā)現當這個基序被從內源靶基因刪除后，REF6不能正確的結合在靶基因上，因此從體內證明了該基序確實是REF6識別靶基因必不可少的元件。研究人員認為該CRISPR/Cas9技術應該能廣泛應用于體內驗證由ChIP-seq所發(fā)現的DNA基序。

原文標題：

Verification of DNA Motifs in Arabidopsis using CRISPR/Cas9 Mediated Mutagenesis