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          Science發(fā)布生物工程壯舉:讓DNA堿基從4個變成8個


          深圳子科生物報道:伴隨了我們幾十億年的4種A、G、C、T遺傳密碼子組成了世界上有機體的DNA,但一項最新研究顯示,科學家將遺傳密碼子核苷酸從四種擴充到了八種,這些核苷酸的外觀和行為與天然的核苷酸相似,甚至可以轉錄成RNA。

          這一研究成果公布在2月21日的Science雜志上,研究人員表示,這種被稱為“hachimoji”系統(tǒng)能存儲天然核苷酸兩倍的信息,未來也許能應用到合成生物學等多個領域。更重要的是,這一擴增的遺傳密碼系統(tǒng)可為能支持生命的更大、更復雜的分子結構提供新的線索。

          來自西北大學的Michael Jewett(未參與該項研究)評論道:“這真是一篇令人興奮的論文……真正的生物工程壯舉。它增加了DNA和RNA構建模塊的數(shù)量,大大擴展了核酸的信息密度?!?

           “這提出了一個重要問題:在生命起源的時候,為什么是這四種核苷酸構建了生命密碼子?為什么不能是八種,或者其它的數(shù)量呢?”

          構成生命化學藍圖的基因密碼

          在過去的40億年間,只有鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C),以及腺嘌呤(A)和胸腺嘧啶(T),或者對于RNA來說的尿嘧啶(U),這些構成了大自然創(chuàng)造地球上無窮無盡的生命所需要的一切。

          但是領導這項研究的Steven Benner博士認為,理論上還能有更多。比如嘌呤(G或A)通過氫鍵與嘧啶(C,T或U)連接時形成堿基對,還有其他嘌呤和嘧啶型結構可以假設連接產生與標準DNA相同的螺旋結構。

          Benner已經計算出,由八種新型結構形成的總共四個額外的氫鍵合堿基對是可能的。他說,DNA從根本上并沒有完全利用其結構限制?!耙虼?,DNA分子可以擴展……你實際上可以添加更多的字母”。

          之前,Benner研究組已經合成了兩種核苷酸:Z和P,并證明了將它們加入到DNA中,也可以在體外復制和轉錄?,F(xiàn)在,他的團隊增加了另外一對堿基——S和B.

          Hachimoji DNA

          研究人員將化學合成的新核苷酸整合到雙鏈寡核苷酸(也含有G,A,T,C,Z和P)中,然后檢測分子的熔解溫度,結果發(fā)現(xiàn)觀察到的熔解溫度平均在預測值的2.1℃內,這也是標準DNA寡核苷酸的誤差范圍。

          “這項研究證明你可以將DNA的堿基翻倍,并且具有可預測化學特性,我認為這是一項具有里程碑意義的成就,”Scripps研究所的Floyd Romesberg說(未參與該項研究)。

          從化學上講,hachimoji DNA的外觀和行為與標準DNA相似。然而,找到讀取和處理核酸的酶卻很難,因此為了將hachimoji DNA轉錄成RNA,研究人員嘗試了許多噬菌體RNA聚合酶變體,最終他們發(fā)現(xiàn)了一個。

          利用這種RNA聚合酶,研究小組轉錄了一種已知RNA適配體的hachimoji版本,并加入了特定的熒光團。果然,轉錄的hachimoji RNA按預期發(fā)光了。

          這種制作功能性RNA的能力“在RNA生物技術領域開辟了許多可能性,”卡迪夫大學的生物化學家Nigel Richards(未參與該項研究)說。他解釋說,RNA可以是催化分子,所以“能有更多的官能團,可以不同的靶標分子進行不同類型的相互作用……增加催化范圍?!?

          Hachimoji DNA甚至可以與基于不同堿基配對的其他類型人工核苷酸結合,從而進一步提高功能性。

          原文標題:

          S. Hoshika et al., “Hachimoji DNA and RNA: A genetic system with eight building blocks,” Science, 363:884–87, 2019.

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